卡氏肺孢子虫简称肺孢子虫，广泛存在于人和其他哺乳动物的肺组织细胞内，可引起肺孢子虫性肺炎，或称肺孢子虫病。卡氏肺孢子虫为一种威胁人类健康的机会致病寄生虫。卡氏肺孢子虫寄生于鼠、犬、猪、羊、兔等和人的肺上皮细胞中引起的寄生虫病。卡氏肺孢子虫于1909年在枯氏锥虫感染的豚鼠肺脏组织切片中发现，分类地位尚未确定。

超微结构发现，孢子虫的壁属真菌性质，内部结构与原虫有亲缘关系。发育史尚未查明，呈散发性流行，见于欧洲、美洲。鼠类可能是传染源，犬可能是贮藏宿主。卡氏肺孢子虫寄生于人和其它哺乳动物的肺组织内，可引起卡氏肺孢子虫肺炎)或称肺孢子虫病，是一种威胁人类健康的机会致病原虫。其分类地位尚未明确，因其有孢子增殖阶段，暂为孢子虫纲的原虫。

在肺渗出血液中，都能找到卡氏肺孢子虫，因而可以确定间质浆细胞性肺炎是由卡氏肺孢子虫引发，由此也叫卡氏肺孢子虫肺炎(PCP)。由此也成为艾滋病患者最常见的机会性感染，并是其致死的主要原因;其次，恶性肿瘤、器官移植术后、恶性营养不良、大量的免疫抑制剂、抗肿瘤药物的应用以及放射线照射等造成机体免疫功能低下，易诱发本病，故越来越受到国内外重视。

卡氏肺孢子虫生活史中主要有两种型体，即滋养体和包囊。滋养体呈多态形，大小为2～5μm，胞质为浅蓝色，胞核1个，呈深紫色。电镜下，滋养体表面有许多微细的管形突起。包囊呈圆形或椭圆形，直径为4～6μm,囊壁较厚，姬氏染色的标本中，囊壁不着色，透明似晕圈状或环状，成熟包囊内含有8个囊内小体(intracystic bodies)，每个小体都呈香蕉形，横径1.0～1.5μm，各有1个核。囊内小体的胞质为浅蓝色，核为紫红色。

卡氏肺孢子虫在人和动物肺组织内的发育过程已基本清楚，但在宿主体外的发育阶段尚未完全明了。一般认为本虫的包囊经空气传播而进入肺内。动物实验证实其在肺泡内发育的阶段，有滋养体、囊前期和包囊期三个时期。滋养体从包囊逸出经二分裂和内出芽和接合生殖等进行繁殖。滋养体细胞膜渐增厚形成囊壁，进入囊前期;随后囊内核进行分裂，每个核围以一团胞质，形成形成囊内小体。发育成熟的包囊含8个囊内小体，以后脱囊而出形成滋养体。